были похожие ситуации.
если точно известно что косяг менять однозначно до прохождения границы (пусть едет по копии), как написано выше.
если инвойс идет с занижением суммы, то на СПБ можно отделаться предоставлением нового, приложив письмо об ошибки и расстаможиться, а вот обратная ситуевина не действует, корректируют
у нас поставщик случайно перепутал валюты и вместо долларсов впечатал евро. оказалось доказывать бесполезно (в контракте написано что могут быть разные валюты).
так же было что не сделали перерасчет и вбубенили цифирки в долларах, а написали валюту евро. а всё почему - блин копеечку пытаются заработать, а декларанту геморр.
