45 - значение после / берется, обычно, программой заполнения ГТД автоматически, исходя из метода, по которому заполнена ДТС к этой ГТД.

46 - наглядно можно увидеть исходя из графы 20 ГТД + графа 17 ДТС1.

Если таможенная стоимость товара включает расходы только (и ровно) до границы РФ - "ставим галочку". Если включает расходы еще и от границы РФ до места назначения - т.е. нет возможности вычленить кускок стоимости доставки от границы до места, - "галочку не ставим".