[Чучмек]

Тогда получается на лодку таможня должна выдавать ПТС (паспорт транспортного средства), но согласно п.2 совместного приказа МВД России, Минпромэнерго России, Минэкономразвития России от 23 июня 2005 г. 496/192/134 "Об утверждении Положения о паспортах транспортных средств и паспортах шасси транспортных средств"
Паспорта выдаются на полнокомплектные автомототранспортные средства с рабочим объемом двигателя 50 куб. см и более и максимальной конструктивной скоростью 50 км/час и более, прицепы к ним2, подлежащие регистрации в Государственной инспекции безопасности дорожного движения Министерства внутренних дел Российской Федерации3, и на шасси транспортных средств4, не входящие в комплект транспортного средства, принадлежащие юридическим лицам, гражданам Российской Федерации, иностранным юридическим лицам и гражданам, а также лицам без гражданства в порядке, установленном настоящим Положением.
не стыковочка

Никакой нестыковочки. Именно в силу этого "Положения". На мопеды ведь тоже ПТС не выдают, хотя они уж точно "автомототранспортные". Да?