Кое что по бухучету при экспорте
http://www.btr-k.ru/publications/1cbuh8/574/
То есть что бы не запутаться в бухучете может обращаться только один документ - счет -фактура. А инвойсам целесообразно присваивать аналогичные номера с префиксом в виде номера контракта.