"Автоматом" всё равно навряд ли аннулируется (ну только если вдруг таможня сама...).
"(Требование об уплате там. платежей) было выставлено и на там. представителя" - а он это требование выполнил? Если заплатил, то (коль уж "прозёван" срок на обжалование) пусть подаёт заявление о возврате, приложив, в качестве подтверждения факта излишней уплаты, решение суда... Даже если отказ получит - на "раз плюнуть" отобьётся!