[Vovez]

Украинской компании тоже необходимо применить режим переработки (только на таможенной территории Украины), тем самым не нести расходы по уплате таможенной пошлины и НДС при ввозе сырья. В том и дело, что вопрос не чисто финансовый, а как на практике может работать такая схема. Согласится ли в данном случае таможня России дать разрешение на переработку вне таможенной территории или нет?

Нет. Без вариантов.
А вот с таможней Украины пусть переработчик порассуждает. Хотя сомневаюсь я. Думаю, все на вопросе об идентификации зависнет.