[Ken-T]

Это было бы так, и было бы слишком радостно и радужно для всех тех, кто в декларации заявлял бы не тот товар, что ввезён...

У ТС (как я поняла, пробежавшись по судебным актам) в декларации и в товаросопроводительных документах) заявлены, среди прочих, два товара НЕ те, что на самом деле завезены... Выяснилось это в ходе таможенного досмотра, возбуждено дело об АП...
И они теперь пытаются доказать, что это не они (и не отправители) виноваты в этой путанице и недостоверке, а таможня, ибо нефик ей было регистрировать декларацию...

Ааааа, ну здесь "тады ой". Не таможня заявляла сведения в ДТ.
А перечень оснований для отказа в регистрации ДТ указан только в статье 190 ТК ТС. И никакой приказ ФТС, пусть даже и зарегистрированный в МЮ, не может дополнить этот перечень.