Если импортер будет подавать ТД, то конечно он и будет обеспечение предоставлять. А если транзит будет оформлять перевозчик, то это будет исключительно его головная боль.
Не сможет перевозчик приготовиться для оформления обеспечения, будет платить заказчику за простои на границе пока не предоставить в таможню обеспечение транзита.