Вот низнай, сам догадываешься или нет, но на всякий случай...
Таможня, увидев, что в одном счёте транспорт есть, а в другом нет, оччень сильно захочет и ко второму счёту тоже какой-ньть транспорт приплюсовать. Например, тоже 200, как и в первом.
Так что я бы запасся письмом от продавца с разъяснением, что, мол, "эти 200 евро, указанные в счёте №1, распространяются и на товары, указанные в счёте №2. Т.е. 200 евро - это стоимость транспортировки ВСЕХ товаров по обоим счетам".
Ну, типа такого.