[Я - то что надо]

с весом нетто понятно, но как высчитать вес брутто, если товары по 1 коду может находятся частично в 2 коробках? чему он будет равен и как в случае досмотра таможня будет взвешивать?

Если в ДТ четыре товара и по факту они находятся в одной коробке, Вы вправе распределить вес этой коробки между товарами по своему усмотрению, исходя из имеющихся у Вас предпочтений (хоть пропорционально массе каждого товара, хоть объёму, а хоть и стоимости). Это действие законодательно не урегулировано.