[denam]

Добрый день. Подскажите, если таможенная декларация зарегистрирована, а ветеринарный контроль не пройден, это правонарушение?

Теоретически-да.
Но если успеваете на второй день предоставить контроль, скорее всего прокатит и выпустят. Устриц ел.