[Бегунок]

Вообще могут печати не ставить. В Приказе ФТС России от 17 сентября 2013 г. N 1761
о печатях слова нет (как ранее было в 395 Приказе)

39. Таможенные органы распечатывают копии электронных документов, в том числе ЭДТ, авторизованные сообщения и протоколы информационного взаимодействия лиц на бумажных носителях после выпуска или отказа в выпуске товаров в следующих случаях:
а) по обращению декларанта в порядке, определенном правилами ведения делопроизводства в таможенных органах;
б) по запросу правоохранительных, судебных органов в случаях, предусмотренных законодательством Российской Федерации;
в) выявления признаков преступления и (или) административного правонарушения, отнесенных к компетенции таможенных органов, при возникновении необходимости использования документов на бумажных носителях, а также при поступлении информации от правоохранительных подразделений таможенных органов, осуществляющих оперативно-розыскную деятельность;
г) необходимости направления документов по международным запросам (при отсутствии технической возможности направления документов в электронной форме);
д) необходимости хранения оригиналов документов, представленных при таможенном декларировании товаров в письменном (бумажном) виде.
В случаях, определенных подпунктами "б" - "г" настоящего пункта, документы могут распечатываться до выпуска товаров.

Вы немножко не правы. Печати ставяться.
О применении пункта 39 Приказа 1761 таможня должна руководствоваться письмом ФТС России № 04-48/00329 от 13.01.2015