[Vovez]

Правильно ли я поняла, что на часть утерянного товара нужно менять таможенный режим, оплатить все сборы и пошлины, а оставшуюся часть оборудования вывозить обратно?

Безусловно. Если хотите обойтись без штрафных санкций. Или всё то же самое, но со штрафами.