[пенсионер]

Иными словами, на момент пересечения товаром таможенной границы при вывозе имелось а наличии два договора, заключённых между одними и теми же лицами: договор о временном вывозе оборудования и договор о проведении калибровки оборудования. Так?
В этом случае товар должен был помещаться под процедуру переработки вне таможенной территории с указанием в ДТ обоих договоров.
Как поступить, если этого сделано не было при вывозе? Я, пожалуй, сначала завершил бы процедуру временного вывоза помещением товара под процедуру экспорта и ввёз товар, поместив его под процедуру выпуска для внутреннего потребления, указав в качестве таможенной стоимости стоимость с учётом работ по калибровке.

Мало таможенных процедур, еще бы пару добавить
Калибровка это не переработка, хотя поднатужившись таможня будет утверждать что это ремонт, а значит переработка.