[ИгорьЮ+]

"много букв, вопрос действительно ли может таможенный инспектор списать только часть платежей (ТП и НДС) по части товаров по которым нет вопросов в случае если отказ в выпуске по другой части товаров. или у него это никак не может выйти и ему придется списывыть все платежи. то что будет потом - заявления, сверки - это не по теме"

Пошлина и НДС должна быть списана только по товарам выпуск которых разрешают, а по отказанным в выпуске нет.
Однако, так деньги и зависают на таможне, как излишне уплаченные, а по истечении установленного срока уходят в бюджет.

Вы с чего это взяли? Каким НПА вы руководствуютесь? Кто мешает после отказа запросить остатки и написать заявление на возврать, тем более , что срок этот - три года