[Бегунок]

Товар планируем отправить по гарантии на ремонт/замену - определенно сказать сложно; не известно возможен ли будет ремонт. Но, идентифицировать товар можно по серийникам и артикулам, а их сделают такими - какие нужны мне; с этим просто. Товар представляет панель управления для автопилота на морское судно(магнитола в машине - только больше и функционал расширение). Поэтому только сборы.

Отправка авиатранспортом с пересечением границы после взлета самолетика, вроде в этом случае транзитка не нужна?

Обратно поставка будет на условиях CPT (в договоре это прописано и в пункте про гарантию тоже это прописано). Почему Вы думаете что реимпорта не получится?

В таком случае Ваш выход - переработка вне таможенной территории.
Глава 25 ТК ЕАЭС.
Вывоз на ремонт - в качестве разрешения - подача ДТ.
Туда только сборы. Обратно сборы и платежи с работы по ремонту и транспортным расходам за бугром (и туда и обратно).