[Татьяна Александровна]

Очень много НО.
У вас это сырье? Скорее всего расходуемые материалы. Тогда стоп. Дальше можете не считать.
4. Таможенная процедура временного ввоза (допуска) не применяется в отношении следующих категорий товаров:
1) пищевые продукты, напитки, включая алкогольные, табак и табачные изделия, сырье и полуфабрикаты, расходуемые материалы

Если это прошли, то да маркировать каждый мешок или пломбу наносить. Хотя это вас не спасет. Дырочку проковыряете, нужное высыпите, а ненужное обратно в мешок запихаете.
Если и это пройдете то
+ вам надо обеспечение внести
Договор вы можете оставить купли продажи и не трогать. Процедуру выбирает декларант, а не договор.
Но думаю до этого не дойдет.

Ваш выход таможенный склад. Потом ИМ40 одного мешка. Крутите-вертите и решаете куда всё остальное.

Для нас это товар, не сырье, планируем перепродать, но конечный покупатель использует в своём производстве как сырье...