Стоит обратить внимание на Письмо ФТС № 05-11/11386 от 05.04.2006 "О взимании таможенных сборов за таможенное оформление и начислении пени"
Рекомендую также прочитать
статью юриста TARGO GROUP, демонстрирующую на практике разрешение в судах спорного вопроса о взимании сборов за таможенное оформление каждого заявления на поставляемые компоненты машины.