Акт выверки платежей необходим если вам нужен возврат не по одной платежке, и у вас за время ВЭД скопилось много "неизрасходованных" платежек.
Если речь идет об одной платежке (например возврат обеспечения) то конечно только одно заявление и больше ничего.