Может я чего не понимаю? ВТТ - таможенная процедура. ТИР, депозит, сопровождение - способ обеспечения ПРИ осуществлении процедуры ВТТ. Изменение обеспечения не может повлечь "пропажи" обязательной процедуры, определённой таможенным кодексом. Так же оформляется ТД с приложением ТСД, где, в отличии от депозита, в качестве документа, подтверждающего обеспечение уплаты таможенных платежей, вместо сертификата выступает книжка МДП.
ВТТ чисто внутрироссийская процедура при доставке от (до) границы до (от) пункта НА территории РФ.
МТТ - таможенный режим для товаров при их перевозке между двумя точками на границе РФ, ЗА её пределы.
Может Вас путает то, что МТТ может возникать и ДО границы РФ при следовании товара из одной страны в Россию через территорию третьей страны. Но такой МТТ не регулируется российским таможенным звконодательством.