Сейчас все документы формализованы, и могу с достаточной степеью уверенности сказать что нет таких рисков в которых указано что надо все делать по бумаге. В ЭД1 (и ЭД2) была предусмотрена возможность запроса дополнительных документов через каналы связи и декларант присылал формализованный документ либо отсканированную копию.
Нельзя было только декларировать лицензируемые товары которые списываются на обратной стороне лицензии и некоторые товары с особыми разрешениями. Так что перевод в бумагу - суть перестраховка таможенного органа.