[BVasilevs]

А если ПИ уже оформлены?

Не совсем понял. Протоколы оформляются в рамках сертификационных работ после принятия Решения по заявке органом по сертификации.
Следовательно протокол не может быть оформлен ДО регистрации Заявки на сертификацию.