[user's]

В моём примере изготовитель начал производство изделий 01/01/2017 и завершил 01/10/2017, изготовив 1 млн.единиц.

Таким образом, он изготовил, сиречь, "произвёл" конечное множество товара. Или "партию продукции", как Вы (заметьте, вполне самостоятельно, никто Вас к этому не понуждал) её определили.

Российская компания "Б" вправе представить любое количество товара из данного миллиона, вне зависимости от того, где ею эти образцы приобретены: то ли из ста тысяч, ввезённых в Россию компанией "А", то ли в другом, угодном ей месте.
Почему? Потому, что миллион изделий представляют собой "конечное множество произведённого товара", то есть "партию продукции" в Вашей интерпретации этого, отсутствующего в нормативных актах, понятия.

Сколько вообще произвел единиц Товара Производитель - это его личное дело.
Покупатель "А" сертифицировал "партию товара" именно на 100т.шт. Так будет записано в его ДС/СС и контракте. Отбор проб и образцов должен производиться из этих 100т.шт. уже произведенных и лежащих на каком-либо складе для Покупателя "А".
Сертифицируется именно эта партия, а не мифический объем производства (для этого существует "серийный выпуск").