Намек на основании чего заполняется страна происхождения можно получить из Инструкции о заполнении ДТ по графе 34 (РКТС 257 от 20.05.2010):
-маркировка на товаре
-коммерческие документы
-транспортные документы
-иные документы (например описание товара)
Если сведений взять неоткуда, ничего не мешает ставить "неизвестна".
Насчет требований к инвойсу - есть Формуляр-образец унифицированного счета (инвойса) для международной торговли. Рекомендация №06 Европейской экономичесой комиссии ООН (Женева, сентябрь 1983 г.)
http://www.cntd.ru/458204270.html
Но это опять же, рекомендация. В разных странах правила оформления счетов разные, так что надо работать со своими поставщиками по содержанию инвойса.