По-моему, здесь происходит смешивание тёплого с мягким...
Объектом таможенного законодательства является товар, перемещаемый через таможенную границу РФ.
Таким образом, если товар, принадлежащий росс. юр. лицу продан опять же росс. юр. лицу, но при этом товар не пересекает таможенную границу РФ, то, соответственно, он не является объектом там. законодательства и не подлежит таможенному оформлению.
Если же товар пересекает таможенную границу РФ - то он подлежит таможенному оформлению в установленном порядке. При этом сделка не считается внешнеэкономической, но это никоим образом не отменяет обязанность российской стороны сделки задекларировать ввозимый товар.
Или Вас интересует этот вопрос в бухгалтерском аспекте?