[Бегунок]

Верно. Когда по одной ДТ идет несколько машин или вагонов и одна или несколько машин или вагонов отстали или сломались, на граница таможня это увидит и отметит у себя, что по ДТ фактически вывезено меньше.
Если же машина одна, то как то надо зафиксировать, что в ней меньше товара, чем в ДТ.
Как это сделать я не знаю. Разве можно после выпуска без участия таможни исправить товаросопроводительные документы ?

Ну если по вагонам, то например по Акту общей формы на сортировочной.