когда российский лицензиат выплачивает иностранному лицензиару роялти , НДС уплачивается лицензиатом как налоговым агентом в бюджет.
в некоторых договорах этот НДС удерживается из роялти, в других - нет .
Но таможне все равно  запрашивают платежку об уплате НДС и добавляют в ТС |
Разобрался, у Вас наверно за товарный знак платежи, а у нас за Ноу-хау, они НДС не облагаются.