[punch_s]

Спасибо за комментарии!

Подытожу.

Графа 11 ДТС-1 заполнена с нарушением установленного порядка её заполнения.
Также с нарушением установленного порядка заполнена графа 45 ДТ и графа 12 ДТ.

Статьёй 111 ТК ЕАЭС (пункт 5) установлено, что таможенный орган отказывает в регистрации ДТ в случае, если "таможенная декларация заполнена не в соответствии с установленным порядком ее заполнения".
Таким образом, в регистрации ДТ таможенным органом должно быть отказано, а регистрация ДТ является незаконным действием.

В графе указывается цифровыми символами таможенная стоимость декларируемого товара в валюте государства - члена Союза, таможенному органу которого подается ДТ, определяемая в соответствии с международными договорами и актами, составляющими право Союза.
Полученное значение таможенной стоимости округляется по математическим правилам с точностью до двух знаков после запятой.
В Республике Армения указывается полученное значение таможенной стоимости, округленное по математическим правилам до целой величины.
Графа не заполняется при декларировании национальной валюты государств - членов Союза, иностранной валюты (кроме используемой для нумизматических целей), ценных бумаг, выпущенных в обращение, а также при помещении товаров под таможенные процедуры таможенного склада, уничтожения, отказа в пользу государства, под специальную таможенную процедуру;

Стоимость указана цифровыми символами? Указанное значение округлено до двух знаков после запятой? Товар помещался под процедуру ИМ40, и при этом не является валютой и ценными бумагами?

Не усматриваю в вашей ситуации нарушения "Порядка"