Таможенная стоимость на условиях EXW

в ТС не включаются налоги, взимаемые в РФ - я о НДС уплачиваемом в РФ (счет от резидента резиденту).

Коллега, Вы не платили налог в бюджет. У Вас Получатель платежа резидент, а не бюджет. Вы просто ВЫДЕЛИЛИ сумму НДС, но не более того.