прошу помощи при расчете НДС при растаможке

[SandySoft]

В соответствии с условиями заключенного Вами контракта стоимость приобретаемого оборудования, скорее всего, указана на условиях CIP Географический пункт. Согласно Инкотермс-2000 Продавец несет обязанность по оплате транспортировки и страхованию груза (см. п. А.3). Поэтому при заключении контракта и выставлении счета на таких условиях Продавец учитывает эти расходы.
Т.е. в стоимости оборудования, выставленной Продавцом на этих условиях, им уже заложены все затраты на транспортировку и страхование до географического пункта.
Тем не менее, если Вы сможете документально подтвердить расходы на транспортировку оборудования по территории РФ (от границы с Литвой до географического пункта внутри РФ), то можете вычесть эти расходы при вычислении таможенной стоимости оборудования.
Таможенная стоимость (ТС) оборудования в Вашем случае будет равна:
1) стоимости оборудования в соответствии с контрактом на условиях CIP географический пункт (если Вы не можете документально подтвердить расходы на территории РФ) или
2) стоимости оборудования в соответствии с контрактом на условиях CIP географический пункт минус стоимость расходов на транспортировку по территории России (если Вы можете документально подтвердить эти расходы)
Еще раз обращаю Ваше внимание на то, что расходы на страхование и транспортировку до географического пункта уже есть в стоимости оборудования.
НДС в любом из приведенных случаев будет вычисляться так: НДС = (ТС оборудования +таможенная пошлина) * 18%