Отгрузка в Казахстан

....Казахстан выставляет нерезиденту счет без указания НДС в любом случае. А вот по возмещению НДС, здесь вопрос...

вопроса тут нет никакого, если резидента Казахстана российская фирма не известит о том, что товар не будет вывезен, а будет реализован на территории Казахстана и казахская фирма отгрузин товар со ставкой НДС ноль поцентов как на экспорт, то получится такая картинка:
- так как казахской стороне никто не подтвердит уплату косвенных налогов в виде НДС резидентом РФ и он не получит Заявления из РФ об уплате НДС, то согласно Соглашения о взымании косвенных налогов и не будет подтвержден вывоз товара за пределы Казахстана, то резидент Казахстана обязан исчислить НДС 12% с суммы сделки и уплатить в бюджет Казахстана.

Если резидент Казахстана однозначно уверен, что товар проданный нерезиденту не предназначен для вывоза за пределы Казахстана, то на этот товар не распространяется действие Соглашения о взымании косвенных налогов, так как товар не перемещается через границу Казахстана и резидент Казахстана обязан (!) отгрузить товар со ставкой НДС 12%

Резидент РФ, купив товар на территории Казахстана, осуществляет хозяйственную деятельность вне территории России и соответственно обороты по реализации вне территории РФ налогом НДС не облагаются согласно НК РФ, то есть он обязан продать купленный товар в Казахстане с нолевой ставкой НДС нерезиденту-казаху.
И опять товар выпадает из Соглашения, так как не перемещается через границу.

Ну и не забывайте, что при определенных условиях резидент России осуществляя такие трюки ушами может рассматриваться налоговой службой Казахстана как субъект предпринимательства осуществляющий деятельность на территории Казахстана без открытия представительства со всеми проблемами из этого вытекающими.

Вся пестня...