Скидка -как правильно оформить скидку

[qazxcmd]

Здравствуйте!

Как по вашему мнению лучше оформить скидку при следующих обстоятельствах:

Поставщик дал скидку 3%, по контракту мы оплачиваем 20% предоплаты, и 80 по факту отгрузки. Цены в контракте не фиксированы, но и про скидки ни слова нет.
Пока я был в отпуске, коллеги с поставщиком в проформе инвойс выставили цены на товар без скидок, сумму без скидки, но в конце написали ,что на данный заказ предоставляется скидка 3% с нашей стороны предоплату оплатили от полной суммы, без учета скидки, расчитывая учесть её при оплате доплаты по коммерческому инвойсу.
Наш юрист говорит, что дело плохо и это будет выглядет не правильно, если мы вычтем 3% от стоимости доплаты при оплате коммерческого инвойса.