авансовые платежи.

Акт выверки платежей необходим если вам нужен возврат не по одной платежке, и у вас за время ВЭД скопилось много "неизрасходованных" платежек.
Если речь идет об одной платежке (например возврат обеспечения) то конечно только одно заявление и больше ничего.

В 607 установлен перечень необходимых документов. Никаких актов выверки там нет.
А в результате чего появляется акт выверки?