Два инвойса на поставку на разные компании.

[Алексей2008]

Разделить не проблема. А получателем в авианакладной кого ставить? И как быть, когда один получатель в ДТ не будет совпадать с получателем в AWB?

Часть товара по 2 оплате: указываете покупателя2 как и положено.
По 1 предоплате: получателем груза в ДТ и накладных укажите покупателя2. А покупатель1 будет фигурировать как покупатель. В инвойсе в электронном виде формализуете:
грузополучатель: покупатель2
покупатель: покупатель1