изменение таможней кода ТН ВЭД повлекло предоставление сертификата и статью 16.3 КоА

ну что сказать касатик, суд это хорошо (кстати какая инстанция?). вообще то ссылаться на письмо при принятии решения судом не серьезно. письмо это ничто.

ну а практика она разная, есть например такая. достаточно свежее постановление.

Постановление ФАС Дальневосточного округа от 07.05.2009 N Ф03-1923/2009 по делу N А51-9583/2008
Факт непредставления при подаче временной грузовой таможенной декларации на товар, принадлежащий покупателю, ветеринарного сертификата является основанием для привлечения таможенного брокера к административной ответственности, установленной частью 1 статьи 16.3 КоАП РФ.

да и в тк рф умные люди в ст. 145 зачем-то написали, что брокер может быть привлечен и по ст. 16.3. ась?))) не с проста это. ох не с проста.

ладно. отпишитесь как там в следующих инстанциях будет складываться. удачи.