Включение в ТС комиссии за фрахт

[Quantum satis]

не понял: как комиссия относится к оплате доставки?

Наверное, так: комиссия является частью расходов, понесённых на перевозку товара.
В случае, если таковые расходы не включены в цену товара, уплачиваемую покупателем продавцу, они должны включаться в таможенную стоимость декларируемого товара.

[alexisk]

банковская комиссия тоже является частью расходов по оплате за товар

[Quantum satis]

банковская комиссия тоже является частью расходов по оплате за товар

Банковская комиссия уплачивается покупателем банку, а не продавцу. И, соответственно, не входит в "цену товара". Хотя, частью расходов по оплате за товар, она, безусловно, является.