В Вашем случае будет применяться особый порядок декларирования, и как Апрель выше сказал, при рассмотрении на предмет классификаци ФТС должно было учитывать это обстоятельство.
Да и сам 388 ломает понятие товарной партии,данной в 1057, ИМХО.
В нём есть условия, когда он работает
например,
"
4. Отдельные компоненты машины, представляемые для таможенного оформления несколькими партиями в течение установленного данной Инструкцией периода времени, могут классифицироваться как машины, оборудование, механизмы, устройства, установки, аппараты и т.п., в отношении которых установлена адвалорная ставка ввозной таможенной пошлины, по единому коду ТН ВЭД при выполнении следующих условий:
.....
г) все компоненты машины поставляются в
адрес одного получателя по
одному договору (внешнеторговому договору, включая договор лизинга, или иному договору, в соответствии с которым российские товары ввозятся на территорию особой экономической зоны (далее - ОЭЗ) и помещаются под таможенный режим свободной таможенной зоны), условиями которого предусматривается поставка отдельных компонентов в определенный период времени, или без договора в случае ввоза товаров в уставный (складочный) капитал организации;"