Насчет Акцизной таможни подсказать не смогу, а насчет перемещения по ВТТ вкратце схема выглядит примерно так:
В соответствие с п.1 ст. 80 ТК РФ получаете разрешение на ВТТ у начальника таможенного органа, в регионе деятельности которого находится груз (откуда начнется его перевозка).
В соответствие со ст. 86 ТК РФ решаете "вопрос соблюдения законодательства при ВТТ" ("внесение обеспечения уплаты таможенных платежей", проще говоря). Для этого, скорее всего, согласно положениям
Распоряжения ГТК от 09.12.2003 № 666-р оформляете гарантийный сертификат.
Оформляете транзитную декларацию по тексту
Приказа от 04.09.2007 № 1057 на бланке или же, пользуясь статьей 81 ТК РФ, представляете в таможенный орган отправления комплект товаросопроводительной документации (накладную, счет и т.п.) для того, чтобы использовать этот комплект документов в качестве транзитной декларации, если в нем содержатся необходимые сведения о товарах.
Пользуетесь Инструкцией о совершении таможенных операций при ВТТ и МТТ, утвержденной
Приказом ГТК от 08.09.2003 № 973.