Добрый вечер!
Задачку не из легких задаете.
Если верить Таможенному кодексу Таможенного союза, а конкретно ст. 280, то в Вашем случае морское судно ввозится то ли на два года (собственно текст статьи,)то ли на срок действия договоров тайм-чартера или бербоут-чартера (п.3 перечня категорий товаров, в отношении которых устанавливаются более продолжительные, чем установленные таможенным кодексом таможенного союза, предельные сроки временного ввоза). Ссылка на перечень дается в тексте статьи.
http://www.consultant.ru/popular/cus..._43.html#p3335
Условия помещения под таможенную процедуру даны там же,а также в 34 главе закона 311- ФЗ.
http://badis.ru/glava_34_tamojennaya...vvoza_dopuska/
По поводу ограничений срока периодом пребывания без регистрации, соглашусь с Вами.
Как все это будет выглядеть на самом деле, сейчас даже А.Ю.Бельянинов вряд ли знает.