Честно говоря не понял.За что 16.2?Значит ОАП некомпетентный.Обжалуйте для начала в Управление.

ИМХО, таможня в своем праве, но пробуйте обжаловать, за малозначительностью, т.к. всё сделали сами и "вредные последствия были устранены" до возбуждения дела

Считаем, что обжаловать в РТУ смысла нет, т.к. данное дело полность РТУ курировало и контролировало, все постановления согласовывались с РТУ, поэтому дорога только в суд.

При рассмотрении протокола в таможне нами было заявлно о прекращении по малозначительности, но нам было отказано, по причине (на наш взгляд) таможня боится ответственности, но и сумма штрафа более 2 млн. руб

Оставлять, разумеется нельзя. Выхода нет- либо РТУ, либо суд. Но, ИМХО, только за малозначительностью.

А почему считаете по малозначительности? Мое менение отсутствет вина, т.к. нами были приняты все меры к устарнению нарушения, реально ушерба для бюджета нет. В настоящее вемя ущерб причинен только нам. Исходя из смысла всего данного дела нас наказали за то, что мы сами выявили сами уплатили.

Надо подумать.

Формально событие правонарушения есть(хотя юристы может иеня поправят),соответственно 2.9 КоАП.Сами выявили,сами отдекларировали,сами устранили.Хотя РТУ и курировало данный вопрос со стороны оперативной таможни(скорее всего),жалобу будет рассматривать правовая служба,да и для суда надежнее пройти все инстанции,чтобы показать всю "мудрость" таможенных органов.Чем больше ляпов они допустят,тем лучше.Пусть Управление обоснует почему оно отказывает в уловлетворении жалобы(если Ваша компания не злостный нарушитель,конечно).

Административное право, особенно таможенный раздел, штука кривая. Я считаю, что на момент выявления таможенным органом отсутствует само событие. Заявление спорное. Но я считаю, что "заявление недостоверных сведений" устранено декларантом самостоятельно как событие, поскольку им до выявления ЗАЯВЛЕНЫ достоверные сведения и произведена доплата платежей. Если ещё и пеню за просрочку рассчитали и доплатили, то вааще...

К сожалению, для образования состава АП в отношении юр.лица наличие вины необязательно.