Спасибо коллеги!
Вопрос конечно заковыристый но база основная есть.

То бишь:
ТАМОЖЕННАЯ ТЕРРИТОРИЯ РФ - экономико-правовое понятие, включающее сухопутную территорию, территориальные и внутренние воды и воздушное пространство над ними. Т.т. РФ включает также в исключительной экономической зоне РФ искусственные острова, установки и сооружения, над которыми РФ обладает исключительной Юрисдикцией в отношении таможенного дела. Единая Т.т. РФ выступает как таможенно-правовое выражение общероссийского рынка, главным внутренним принципом функционирования которого являются отсутствие внутренних таможенных границ и барьеров, свободное движение товаров, услуг и капиталов.


Из федерального закона об основах государственного регулирования внешне экономической деятельности (глава первая «общие положения):
7) внешняя торговля товарами - импорт и (или) экспорт товаров. Перемещение товаров с одной части таможенной территории Российской Федерации на другую часть таможенной территории Российской Федерации, если такие части не связаны между собой сухопутной территорией Российской Федерации, через таможенную территорию иностранного государства не является внешней торговлей товарами;

Исходя из этих двух формулировок получается что таможенного оформления не требуется, но это не освобождает от таможенного контроля. То есть, утрированно, привезти в порт, отгрузить на суда без участия таможни не получится. Подразумеваю что потребуется мешок документов, в частности документы по собственности месторождения и установленного на нем сооружения, проектная документация, сметы, договора и прочее на строительство трубопровода, документы отражающие собственника последнего и тп.

А если абстрогироваться от ситуации и повернуть ее другим боком. Строится трубопровод Калининград - Крыжополь (Калининградской области), трубы российские ввозятся с основной территории РФ, скажем из Челябинска. Вывоз из РФ на территорию Калининградской области ведь так же проходит под таможенным контролем?

К слову...
Была немного другая ситуация. Спасибо Яжъ и Эльзе что помогли разрешить. Отправляли груз на буровую установку (территория РФ) в Тихом океане около берегов Вьетнама. Заявляли ЭК 10 с особенностями перемещения ,кажется 31.

А чем таможня мотивировала режим экспорта?

Вероятно, это была, действительно, другая ситуация.
P.S. Не сумел понять, каким образом у берегов Вьетнама (который вообще-то суверенное государство, омываемое с востока Южно-Китайским морем)) российская территория образовалась?

Подозреваю, что здесь НЕ таможенная территория России. Хоть буровая и российская, но на шельфе Вьетнамском.

Вообще не лишне было бы сам контракт узреть. Вообще эти трубы являются предметом сделки, сделки внешнеэкономической?

Нет не являются, получатель российский резидент курирующий строительство трубопровода и у него в свою очередь контракт с иностранным подрядчиким на проведение трубоукладочных работ с использованием его (подрядчика) техники.
Месторождение Штокмановское. Российские сектор баренцева моря.

А трубы откуда и чьи они?

Трубы российского производства.

Тогда максимум, на что это тянет - на доставку под таможенным контролем. А уж как таможня будет осуществлять этот контроль в такой нетривиальной ситуации - её проблемы.