Разумеется, это так .
Не понял в чём здесь противоречие с тем, что я сказал?

Опять Вас не понял . Таможня обязана доказать отсутствие влияния взаимосвязи на цену сделки? Да ладно.
А заплатить контрагенту вместо импортера нет обязанности у таможни? Вот было бы здорово.
а...ка...ка...я...ка..тит? :D
Вы тоже считаете, что доказывать ничего не надо?
В судах таможня проигрывает не потому, что должна доказать влияние взаимозависимости , а потому что не может доказать факт обнаружения признаков, либо того, что то, что она обнаружила таким признаком является, либо неправомерно пренебрегает доказательствами декларанта об отсутствии влияния.
Повторюсь, заполняя ДТС и декларируя взимосвязь, Вам никуда не деться от доказательства.

есть ПС с практикой работы по жалобам - там написано, что там.орган должен уведомить декларанта что он обнаружил такие-то признаки что повлияла и только тогда декларант идёт и доказывает. Но это довольно странно, получается в ДТС-1 изменения вносить.

Парадокс ситуации в том, что в приказе №536 от 25/04/2007 в п.3 Приложения1 определен конечный перечень документов, которые предоставляет взаимосвязанный с нерезидентом декларант:

3. При определении таможенной стоимости товаров, ввозимых взаимосвязанными лицами по методу стоимость сделки с ввозимыми товарами, если таможенным органом будут обнаружены признаки того, что взаимосвязь между продавцом и покупателем повлияла на стоимость сделки, декларантом представляются следующие документы:

• документы, перечисленные в подпункте "б" пункта 1 настоящего приложения, в соответствии с которыми проводилось таможенное оформление идентичных или однородных товаров, таможенная стоимость которых была определена методом по стоимости сделки с ввозимыми товарами при их продаже на экспорт в Российскую Федерацию покупателям, не являющимся взаимосвязанными лицами с продавцом;
• документы, перечисленные в подпункте "в" пункта 1 настоящего приложения, в соответствии с которыми проводилось таможенное оформление идентичных или однородных товаров, таможенная стоимость которых была определена по методу вычитания;
• документы, перечисленные в подпункте "г" пункта 1 настоящего приложения, в соответствии с которыми проводилось таможенное оформление идентичных или однородных товаров, таможенная стоимость которых была определена по методу сложения

А теперь нужно подумать - откуда у обычного учвэда такие документы? Принести распечатку из "паленой" базы и ссылаться на нее? Или создать еще одного учвэда, который никоим образом не будет аффилирован с отправителем? Так и там тоже никто просто так ниже проходных не даст оформиться...

Остается два пути:

1. отстаивать свою цену: делать оценочные экспертизы (как вариант, в ТПП РФ) и предоставлять их на этапе ТО, делая отметку в ДТС-1 и описи; получая отказ в 1-ом методе, предоставлять документы по запросу (хотя на этом этапе ответ ясен заранее в 99% случаев) и быть готовым к тому, что сумма обеспечения превысит все мыслимые пределы (в несколько раз выше пресловутых проходных); не соглашаться на корректировку и ждать пока инспектор сам заполнит окончательный КТС (на ту сумму, которая ему глянется с утра - или по проходным, или по-максимуму по данному коду); обжаловать в судебном порядке действия таможенного органа; быть готовым к последующим аппеляции и кассации. А деньги так и будут лежать на таможне, в ожидании справедливого решения суда...
2. просто согласиться с проходной. Вопрос не в том, что кто-то слаб в отстаивании своей позиции, а в экономическом расчете. Если КТС носит разовый характер и расходы на переплату таможенных платежей соизмеримы с затратами на судебный процесс - одна ситуация. Если цены реально всегда ниже проходных, КТС носит системный характер, а затраты по корректировке превышают уровень судебных издержек - то совсем другая песня.

И вообще, я очень уважаю РИДДИКа за его непримиримую позицию в отношениях с таможней :)