Тут два аспекта. Первый, это то, что груз при таких сроках оформления, обязан размещаться на хранение под ДО.
Второе. Почему нужно было заявление? Потому, что контейнер в данном случае самостоятельный товар. Классический случай "товар в товаре".
Мне другое интересно, по словам топикстартера, контейнеры - собственные, НО при этом заявляются с товаром вместе в одной ГТД. Следовательно - одна таможенная процедура, один отправитель, один контракт. (1057). Как так?

Контейнеры собственные - они и есть собственные. Они куплены грузовладельцем и поставляются в рамках того же контракта. Что касаемо проведения отдельного досмотра двух товаров (контейнера и товара в контейнере) то почему сам контейнер в помещение склада не поставили?

негабарит. имеют право.

Не понял. 20' или 40' это негабарит?

Для втаскивания в помещение СВХ - безусловно. Для открытой площадки - невопросЪ. Товар, находящийся в контейнере, если по поручению "глубина" досмотра высока, должен быть выгружен в помещение СВХ. А контейнер можно оставить на открытой площадке.

Логично, в общем-то. Странный склад, машина не входит.

А зачем? Есть десяток "присосок" с регулировкой по высоте рампы. Погрузчик как заводной туда-сюда летает. Склад класса "А"

Ну да, ну да. Осинка такая была. Такой терминал загубили, хады...

совершенно верно.

Формально таможня права. Складской выше доложил.