26/12 был отбор проб, а 27/12 выпуск под обеспечение

По-моему, нормально получается. Праздники же были.
До Нового года никто ничего не отвозил или отправлял в лабораторию. Отвезли только после праздников. Даже если с 10 января посчитать, то экспертизу сделать должны были числа 7 февраля. Потом отправить на пост. Где-то так и получится.

а ее сделали 1 марта, зачисление средств в кач-ве пошлин вообще 16 апреля. долговато)))

Значит продлевали сроки. Кодексом это предусмотрено. Зачисление пошлин возможно только после классрешения. А классрешение появляется только через 30 дней после поступления заключения в таможню.

Посмотрите практику ООО "ВТО" по ФАС Дальневосточного округа, возможно мнение Вашего руководства изменится ( только выбирайте дела именно по пени, а не пени с КТС)