При подаче налоговой декларации по НДС "к уменьшению", то есть при попытке возместить НДС из бюджета, ИФНС автоматически назначает камеральную проверку по НДС, включающую комплекс мероприятий по выявлению цепочки продавцов и покупателей, рассылаются запросы во все налоговые по документальному маршруту следования груза.
Если в таковой цепочке обнаруживается фирма-неплательщик НДС, то причитающийся НДС к уплате взыскивается с конечного товарополучателя.
Бывают такие "умные" брокеры, пытающиеся с фирм-учвэдов возмещать НДС - особенно актуально, если фирма занимается и импортом, и экспортом. Какая там "кухня" внутри у брокера, Вы никогда доподлинно не узнаете.
В принципе, если все по цепочке платили НДС, то ужас-ужас может и не настать никогда. А при прозрачных контрагентах и возмещения НДС бояться не надо. Частенько с авансов приходится его возвращать из бюджета.

Правильно я понимаю, что Вы просто покупаете товар зарубежного проиводства по обычному ( не внешнеэкономическому контракту ) у российской компании за рубли ?
А кикие у Вас основания считать их серыми.Возьмите у них копии регистрационных документов, закажите черех инет за пару тройку сотен рублей выписку из ЕГРЮЛ. Если все есть, то Вы проявили разумную осторожность, а платят ли они налоги в нужном размере вопрос конечно интересный, но закон не возлагает на вас обязанности это проверять.
Далее можно предупредить поставщика, что Вы в установленном порядке запросите в таможне факт оформления проданного вам товара по ДТ № ....... ( номер будет в счет фактуре ). Можно так же обязать в договоре продавца предоставить копию ДТ и оригинал потверждения таможне о уплате таможеных платежей по ней.
Кроме того надо учитывать ( что бы не писали выше ) что проверка с запросами проводится как правило в случае если по налоговой декларации сумма вычетов больше НДС начисленного от реализации и просится фактический возврат денег. Например при экспорте купленного товара.
Проверять досконально все сделки внутри россии просто невозможно.

Так оно так, но ДТ не даст ничего собсно, ибо обычно продажа идет не от непосредственного импортера. Налоговую особо декларация кроме нумера не интересует, за исключением случаев продажи товара от прямого импортера, а размер партии явно больше, чем в декларации, причем такое бывает часто и у "белых" импортеров.

Сплошь и рядом у "белых" продавцов всякого дорогостоящего добра объемы продаж импортного товара в разы выше, чем объем этого товара в ДТ при ввозе.
Товар имеет свойство размножаться почкованием :D

париться ещё с копией дт-хи. из базы подходящую выдернули и в фактуру ея.

Так вот у меня так поставщики и "попали"....Диклорация (С) была на них и савсем "белая", но поскольку бухи у них бухи ушастыя и базу деклараций в 1С не вели, такая трабла и вылезла... Мне НДС "входной" подтвердили и возместили, а им долго голову мучили.