Тут посмотри про заполнение пункта 3. Почему нельзя-то?

осталось доказать только что это всё филиалы

ИНОГДА... если на инвойс, бывает хорошо, если есть письмо от ГОЛОВНОГО о том, что "в рамках контрактного производства продукции: артикул и название ... привлекались следующие предприятия, которые есть как филиалы.
Если серийка - мбыть проблемы. Могут попросить контракт на выполнение работ между головой и хвостами :-)Его получить сложно. (Это все не про серты и декларации за 4 тыс руб. извините)

Не обязательно филиалы. Филиал - не есть юридическое лицо, он фактически имеет только адрес. Но если транснациональная корпорация в иной стране имеет производство и статус юридического лица этой страны, то это лицо как изготовитель и прописывается в ДС наряду с основным. По крайней мере в старых ДС было так. Что до ДС ТР, то пока таковых не оформляли.

На данном форуме похожие обсуждения уже были: большинство склоняется к тому, что если указать все заводы, то проблем быть не должно. В моем случае все несколько сложнее: поставщик часто меняет заводы, кроме того, часто бывает, что название завода не меняется, а меняются адреса. Насколько критично изменение только адреса? Выходом было бы оформлять ДСки на инвойс, когда известны заводы и их адреса. Но при небольших размерах партии это накладно, так как при каждой поставке ДС нужна не одна, а довольно много (1 ДС на однородную продукцию). Этикетками поиграть вряд ли удастся, так как я не единственный покупатель, ради меня поставщик ничего менять не собирается.
В чем "ущербность" таких, например, рассуждений: согласно ТР ТС 009/2011 "изготовитель - юридическое лицо, индивидуальный предприниматель, производящие парфюмерно-косметическую продукцию и/или выпускающие в обращение парфюмерно-косметическую продукцию под своим наименованием и/или товарным знаком и несущие ответственность за её соответствие требованиям настоящего технического регламента ТС". Фирма А через уполномоченное лицо (меня) выпускает в обращение товар под своим ТЗ. Разве фирма А не изготовитель? По-моему, изготовитель в соответствии с ТР ТС. Почему ее нельзя без указания заводов указать в ДС в качестве изготовителя?

Какие есть законные основания требовать такие контракты? Так можно дойти до того, что могут потребовать контракты на поставки ингредиентов, комплектующих.

Вот смотри. Есть у тебя, допустим, ДС, в которой изготовителем указан "Хунвейбин Лтд". Он же, есс-но, в 31-й ДТ числится.
И тут - бац! - досмотр. И берёт досмотровый в руки эту чЮдо-продукцию, и читает на ней: "изготовитель - "Лю Сунь Ян ГмбХ" (допустим даже, что "по заказу Хунвейбин Лтд" приписано, сути не меняет).
И нарисовывается "предоставление недействительного документа ..." 16.2.3 КоАП.