в базе так и висит с преференциями,значит не было КДТ

5 евро регламентируется 80 статьей ТК ТС, обязанности по уплате пошлин и налогов
А пени 84 статьей и не относятся к пошлинам и налогам

Если давно, надо знать дату и как регламентировалось внесения изменений в то время.

за месяц до Олимпиады было дело

Какой? :D
Я ещё олимпиаду в Москве 1980 года смотрел по телевизору. :)

в Сочи, видно было без телевизора.тем более нет его у меня

а вот это не подойдёт?
12. Уплата, взыскание и возврат пеней осуществляются по правилам, установленным таможенным законодательством Таможенного союза и (или) законодательством Российской Федерации о таможенном деле в отношении уплаты, взыскания и возврата таможенных пошлин, налогов.

Прекращение обязанности по взысканию пошлин и налогов регламентируется пунктом 2 статьи 80 ТК ТС, а прекращение начисления пени регламентируется пунктом 3 статьи 151 ЗоТР. Там про 5 евро ни слова.

подожди, да пусть они начисляются. они начислены, но взыскать то их нельзя же если менее 5 евро и я упрусь?

ещё такая мысль, что любую сумму требуемую после выпуска можно автоматом занижать на 5 евро, не?