То есть, ДТ Вы выпустили по месту, а заключение просит таможня в порту при выдаче поручения на погрузку на основании выпущенной ДТ. Странно, мне всегда казалось что это не в их компетенции. В приказах ФТС по портам я такого не помню. Я бы для начала попросил у агента линии копию этого требования таможни, так как будут затратытки по хранению и это вопрос надо будет решать с покупателем. И потом, какое заключение нужно таможни, я не вижу что требуют ФСТЭК, может им нужно от направления Минобороныи. А может им будет достаточно, так называемого в народе " эксконта". В требовании таможни это должно быть указано.

Требование никто не предоставил, думаю это частное мнение и разговор об "эксконте".

Это не более чем перебздеть.
Граница на проверку / наличие заключений ЭКСКОНТа вообще не уполномочена.
Письмо о невоенке от отправителя и пусть подкладывают.

Идентификационное заключение участник ВЭД можно оформить самостоятельно.
В соответствии с п.1, ч. 3, статьи 24 ФЗ от 18.07.1999 № 183-ФЗ "Участник ВЭД может самостоятельно оформлять результаты проводимой идентификации контролируемых товаров".
Форма идентификационного заключения утверждена ПП РФ от 21.06.2016 г. № 565.
Мы составили заключение собственными силами. Инспектор принял идентификационное заключение по форме утвержденной ПП РФ от 21.06.2016 г. № 565 и подписанной генеральным директором (Участником ВЭД) и выпустил товар в день подачи.