Всегда было спорным мнением на какой момент нужно иметь лицензию. Я всегда считал на момент ввоза.
Мне кажется сейчас ст. 7 ТК ЕАЭС это однозначно устанвливает. См так же ст. 12

Читаем часть 5. ст. 7
Положением по ввозу порядок подтверждения определен - представление доков при помещении под определенные процедуры. Расписано какие доки и в каких случаях представляются. Т.е. тут неоднозначности нет.

Мне трудно аргументировано спорить, а доступа к НПА нет. Суть в том, что лицензию нужна до ввоза и до ввоза ее надо ставить на учет, а возбудить дело при ее отсутствии можно только после подачи ДТ.

Для учета в работе Решение Комиссии Таможенного союза
от 18 июня 2010 г. N 321
"О едином порядке контроля таможенными органами
ввоза на таможенную территорию таможенного союза в рамках ЕврАзЭС
и вывоза с этой территории лицензируемых товаров"

Для учета в работе :

Приказ ФТС России от 29 декабря 2011 г. N 2652
"Об утверждении Инструкции
о действиях должностных лиц таможенных органов
Российской Федерации, направленных на реализацию Положения
о едином порядке контроля таможенными органами ввоза
на таможенную территорию Таможенного союза в рамках
ЕврАзЭС и вывоза с этой территории
лицензируемых товаров"


В том числе, например :

V. Действия, производимые в таможенном органе,
в регионе деятельности которого расположены места прибытия
(убытия) лицензируемых товаров



24. Таможенные органы, в регионах деятельности которых расположены места прибытия (убытия) товаров, обеспечивают доведение сведений (при их наличии) об этих товарах и лицензиях, выданных на их перемещение, из электронного журнала регистрации лицензии до таможенных органов, расположенных в местах прибытия (убытия).

25. В случае, если иное не установлено положениями о применении ограничений к товарам, включенным в Единый перечень товаров, к которым применяются запреты или ограничения на ввоз или вывоз государствами - членами Таможенного союза в рамках Евразийского экономического сообщества в торговле с третьими странами, утвержденный Решением Комиссии Таможенного союза от 27 ноября 2009 г. N 19 (далее - Решение), таможенные органы в соответствии с пунктом 14 Положения не допускают перемещение через таможенную границу Таможенного союза лицензируемых товаров, в отношении которых оригиналы лицензий не поставлены на контроль в соответствии с Положением.

Это доказывает, что строго говоря лицензия нужна до ввоза. Но если проскочил товар, не беда, надо получить до подачи ДТ.
Вы подали ДТ- Вас обули. Пока товар лежал на СВХ вопросов ведь не было.

Это проект, а не положение. Он отменен 13.06.2018.
Положение было утверждено Решением Комиссии Таможенного союза от 22.06.2011 N 687 (утрачивает силу 06.07.2019).
п. 4 данного положения:
п. 10
п. 14
Приказ ФТС № 2652
П. 20

Если лицензия была нужна, на момент пересечения границы она должны была быть (если только не через Беларусь/Казахстан). И поставлена на контроль. И копия с водителем должна была мчать.
У Вас её не было на момент пересечения границы?

9. Заверенные в соответствии с пунктом 8 настоящего Положения копии лицензии представляются при осуществлении таможенных операций в таможенный орган в соответствии с таможенным законодательством Таможенного союза.

Заверенная таможенным органом копия лицензии либо копия с этого документа представляется в месте прибытия (убытия) совместно с транспортными (перевозочными) и (или) коммерческими документами на каждую партию товара, перемещаемую через таможенную границу Таможенного союза, за исключением случая, указанного в абзаце втором пункта 14 настоящего Положения.

----
При этом, если места прибытия (убытия) товаров и технологий, подлежащих экспортному контролю, в том числе и продукции военного назначения, находятся вне территории государства - члена Таможенного союза, в таможенном органе которого лицензия поставлена на контроль, положения пункта 5 настоящего Положения в части приложения владельцем лицензии к письменному заявлению копии лицевой стороны оригинала лицензии для ее последующего представления в таможенные органы, в регионах деятельности которых расположены места прибытия (убытия) товаров, и абзаца второго пункта 9 настоящего Положения не применяются, если иное не предусмотрено международными договорами в области экспортного контроля и военно-технического сотрудничества, заключёнными в рамках Таможенного союза.

У нас не было лицензии на момент ввоза (была, но с истекшим сроком), т.к. по Положению она может быть поставлена на учет до момента декларирования. Получать планировали после проверки качества продукции.
При ввозе представления лицензии не требуется см. выше пункты + в самом Положении по 2.21 прямо указано, что при помещении под транзит лицензия не нужна.

Кстати если смотреть Договор о союзе Приложение № 7 по нетарифке Приложение по порядку выдачи лицензий, то там написано:
И ни о каком представлении копий на границе речи не идет.
А Акты ТС должна применяться в части не противоречащей новому Договору.
Хотя транзит тоже вроде как декларирование...