А зачем вообще что-то делать с инвойсами, если товар пришел одновременно? Инвойс - это взаимоотношения поставщика и покупателя.

Ведь оба инвойса можно заявить в одной ГТД. ГТД подать на общую сумму+транспортировка.
Какая Таможне разница, в каком инвойс транспортировка включена?
В крайнем случае письмо от поставщика, что транспортировка за оба товара включена в инвойс "такой-то"...

Суть проблемы заключается в том, что на упомянутых условиях поставки стоимость фрахта в инвойсе вообще не должна фигурировать.
Если у Вас в контракте указана стоимость товара на условиях CIP, то это автоматически означает, что в такую стоимость уже включена стоимость фрахта и страховки.

А что мне мешает выделить эту стоимость в инвойсе? Вот захотелось мне. Что не имею право?

Вот допустим есть у меня товар на условиях DDU и я хочу уменьшить таможенную стоимость на сумму доставки от границы до получателя.
Соответственно выделяю в инвойсе стоимость товара и стоимость транспортировки. Кто мне это запретит сделать и на каком основании???

В принципе, - никто не мешает, если суммарно Вы получите цену, зафиксированную в ценовом приложении (спецификации) к контракту.
Но здесь возникают дополнительные вопросы.Т.е. мало того, что Вы должны выделить транспотрную составляющую цены, Вы еще должны убедить таможню в правомерности ее разбивки. На этом вопросе очень многие спотыкались. Проще уж заключаться на FCA, в надежде на то, что экспедитор Вам все грамотно разобьет.
Просто у топикстартера есть 2 инвойса (в одном - есть стоимость фрахта, в другом - нет). Если говорить о том, какой из них оформлен в соответствии с базисом поставки, то это - второй инвойс.

1. Зачем мне убеждать Таможню в правомерности разбивки? У меня ведь оба товара в одной ГТД. То есть правомерность разбивки никоим образом не влияет ни на платежи, ни на достоверность таможенного оформления.
2. Можно заключить и на DDU. Но вот только у автора темы уже заключен контракт и товар пришел. То есть все остальное из теории вероятности.
3. У автора были конкретные вопросы:
"что делать со стоимостью доставки указанной в первом инвойсе? Мне ее плюсовать к цене в этом же инвойсе? или как?"
Мои "конкретные" ответы: ничего не делать. Плюсовать.

Аргументы см. выше.

1. Вы сами упомянули, что хотите "уменьшить таможенную стоимость на сумму доставки от границы до получателя". Для этого Вам, как минимум придется разбить транспортную составляющую на "до границы" и "после границы". Вот тут то Вы с инспектором и пободаетесь.
2. Вы сами предложили рассмотреть вариант с DDU. У автора контракт на CIPе.
3. Не спешите давать автору поспешные советы. Откуда Вы знаете, какая цена у него стоит в приложении к контракту, и насколько она совпадает с тем, что указано в инвойсе? Судя по тому, что топикстартер написал, - инвойсы совсем кривые.

Можно теперь тоже самое показать в первоисточнике? Или я невнимателен? Про два инвойса - нашел. Про одну ГТД на два инвойса - НИНАШОЛ.

Полностью поддерживаю!!! Автору указали на ошибки и варианты как посупить - а как он поступит и как будет доказывать ТС, решать только ему.

Я, видимо, не совсем точно сформулировал мое предположение.

В своем посте №21 я указал "ЕСЛИ ТОВАРЫ ПРИШЛИ ОДНОВРЕМЕННО"

То есть предположил и развил свое предположение. Так как автор никак не комментирует мои рассуждения, значит такая версия имеет право на существование.

А я разве возражаю? Все наши рассуждения - это всего лишь почва автору для размышлений:)